Głównym celem działania Regionalnego Zarządu Gospodarki Wodnej w Gdańsku jest zarządzanie wodami na obszarze nadzorowanych zlewni oraz administrowanie rzekami i kanałami w imieniu Skarbu Państwa.
Ośrodek działa na podstawie ustawy z dnia 22 października 2004 r. o jednostkach doradztwa rolniczego(Dz.U. nr 251, poz. 2507 z póź. zm.) oraz statutu Kujawsko-Pomorskiego Ośrodka Doradztwa Rolniczego w Minikowie.